到目前为止，我国还没有发现大型石英矿床、脉石英、石英岩大多是伴生矿床，储量少，原矿性质不稳定。开采后，很难实现原材料的标准化供应。虽然石英含量低，但结晶粒度粗，一般为超大矿床，值得注意。

缺乏高纯石英的原材料选择和评价标准。过去的研究认为，SiO2含量约为99%的石英原料可以加工制备高纯石英砂，并投入大量的人力、物力和时间。因此，它们仍然不能满足高纯石英砂的要求。高纯石英砂原料不仅要以SiO2含量为标准，还要综合考虑石英的嵌布特性、结晶特性、包装含量和尺寸、杂质离子的分布等性质。

基础研究需要改进。一般高纯石英杂质总含量不超过0.05%，杂质含量很少。工艺矿物学的基础研究不仅需要研究石英的存储状态，还需要研究石英和脉石的嵌布特性。石英中微量杂质的存储形式尤为重要，技术难度高，包括杂质成分、矿物成分、包装形状和类型。
生产工艺不成熟，设备落后。目前，国内高纯石英制造商规模不大，类似车间生产，没有典型的成熟生产工艺。高纯石英砂的产品要求决定了其生产工艺和设备要求，是一个加工行业、陶瓷球搅拌磨、高压电脉冲破碎、新型高效磁选机、电感耦合等离子体发射光谱法（ICPOES）等设备。